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EDUCATION
Une mine d'informations et d'études sur l'ADN
Site dédié aux grandes découvertes et applications liées à l'ADN
Vidéos et animations très nombreuses!
http://www.journaldunet.com/economie/sante/sequencage-adn-low-cost/
Article passionnant sur les enjeux du séquençage à haut débit (A LIRE ABSOLUMENT!)
PORTAILS
National Center for Biotechnolgy Information (NCBI)
Publications scientifiques, recherche de séquences (PubMed, Blast, Orfinder, Taxbrowser...).
European Bioinformatics Institute (EBI)
Outils d’alignement et d’analyses phylogénétiques (Align, ClustalW, Fasta).
Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)
Voies métaboliques, répertoire des gènes et des biomolécules (Pathway, Genes, Ligand).
EXpert Protein Analysis System (EXPASY)
Informations complètes sur les protéines et les enzymes (Swiss-Prot, Enzyme).
Annuaire bioinformatique de l'Institut Pasteur.
Outils bioinformatiques de l'Université du Massachusetts.
Catalogue des outils bioinformatiques.
BANQUES ADN
Banque nucléique américaine. Format de fichier spécifique. Système d'interrogation : Entrez.
European Molecular Biology Library (EMBL)
Banque nucléique européenne. Format de fichier spécifique. Système d'interrogation : SRS.
Banque nucléique japonaise. Même format que Genbank. Système d'interrogation : SRS.
Banque de structures tridimensionnelles des acides nucléiques.
BANQUES PROTEIQUES
Consortium regroupant Swiss-Prot-TrEMBL-PIR.
Banque développée par l'Institut Suisse de Bioinformatique.
Séquences déduites à partir des séquences codantes des banques nucléotidiques EMBL/GenBank/DDBJ.
Séquences protéiques et outils d’analyses.
Structure 3D des protéines. Fichiers PDB téléchargeables ou visualisables en ligne.
OUTILS ADN et PROTEINES
SMS2 (Sequence Manipulation Suite)
Ensemble de petits programmes permettant de générer, formater et analyser des séquences d'ADN ou de protéines
OUTILS PCR
Design et optimisation des amorces.
Design et optimisation des amorces.
Design et optimisation des amorces (logiciel téléchargeable).
Design et optimisation des amorces (logiciel téléchargeable).
Oligocalc ou TmPred ou Promega ou Netprimer
Détermination de la Tm des amorces y compris la méthode thermodynamique.
BIBLIOGRAPHIE
PubMed - Medline Publications dans le domaine des sciences de la vie.
Publications scientifiques avec Google. Très puissant.
BTS BIOTECHNOLOGIES
Présentation du BTS Biotechnologies :
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Plaquette résumée (1 page)
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Fascicule complet (13 pages)
Annales des écrits à télécharger : 2009-2012
Pour obtenir les annales avec corrigés, on peut acheter les ouvrages auprès de l'upbm.
Guide de poursuites d'études après le BTS Biotechnologies : à télécharger ici
Licence Pro Biochimie, biologie moléculaire et cellulaire pour le diagnostic in vitro et les biothérapies
Figures protéines hétérologues
Rubrique réalisée d’après «Travaux dirigés de biochimie, biologie moléculaire et bioinformatique».
G. Coutouly, E. Klein, E. Barbieri et M. Kriat.