​Format STADEN

 

Le plus ancien et le plus simple. Il se présente sous forme d’une suite de 80 caractères au maximum par ligne terminée par un retour-à-la-ligne. Ce format n'autorise qu'une séquence par fichier.

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​Format BRUT

 

Les lettres (bases azotés ou acides aminés) sont en minuscule, groupés par 10. Chaque ligne comprend 6 groupes de 10, et commence par la position de la première base. Pratique pour se repérer dans une séquence, connaissant la position des bases à chercher.

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Voir un exemple en bas de cette page.

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Format FASTA

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La séquence est présentée sous forme de lignes de 70 caractères maximum, précédée d'une ligne de titre (nom, définition ...) qui doit commencer par le caractère ">". Les lettres (bases ou acides aminés) sont toujours en majuscule. Cela permet de mettre plusieurs séquences dans un même fichier.

>gi|93278996|pdb|2C8R|B Chain B, Insuline(60sec) And Uv Laser Excited Fluorescence

FVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPK

 

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Format GenPept (protéine) ou GenBank (ADN)

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